Actinomadura
| Actinomadura | |
|---|---|
| Actinomadura macrotermitis on agar plate | |
| Scientific classification | |
| Domain: | Bacteria |
| Kingdom: | Bacillati |
| Phylum: | Actinomycetota |
| Class: | Actinomycetia |
| Order: | Streptosporangiales |
| Family: | Thermomonosporaceae |
| Genus: | Lechevalier and Lechevalier 1968[1] |
| Type species | |
| Actinomadura madurae (Vincent 1894) Lechevalier & Lechevalier 1968
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| Species[2] | |
| Synonyms | |
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The genus Actinomadura is one of four genera of Actinomycetota that belong to the family Thermomonosporaceae. It contains aerobic, Gram-positive, non-acid-fast, non-motile, chemo-organotrophic actinomycetes that produce well-developed, non-fragmenting vegetative mycelia and aerial hyphae that differentiate into surface-ornamented spore chains. These chains are of various lengths and can be straight, hooked or spiral.[3] The genus currently comprises over 70 species with validly published names with standing in nomenclature,[1] although the species status of some strains remains uncertain, and further comparative studies are needed.[3]
Members of the genus are not characterized chemotaxonomically by type III/B cell walls (meso-diaminopimelic acid and madurose are present) with peptidoglycan structures of the acetyl type. The predominant menaquinone types are MK-9(H4), MK-9(H6) and MK-9(H8). The phospholipid pattern is PI (diphosphatidylglycerol and phosphatidylinositol are present as major phospholipids) and the fatty acid pattern is type 3a (branched saturated and unsaturated fatty acids plus tuberculostearic acid).[4]
Phylogeny
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[2]
| 16S rRNA based LTP_10_2024[5][6][7] | 120 marker proteins based GTDB 09-RS220[8][9][10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Orphaned species:
- "Excellospora japonica" Furihata & Shimazu 1985
- "Spirillospora tritici" Song et al. 2018
Unassigned species:
- "A. albolutea" Tohyama et al. 1984
- "A. azurea" Nakamura and Isono 1983
- "A. brunnea" Patel et al. 1987
- A. hankyongensis corrig. Siddiqi et al. 2019
- "A. luzonensis" Tomita et al. 1980
- "A. maheshkhaliensis" Ara et al. 2008
- "A. melliaura" Matson et al. 1989
- "A. ochracea" Deng & Yan 1984
- "A. parvosata" Christensen et al. 1987
- "A. pulveracea" Iwami et al. 1985
- "A. routienii" Huang 1987
- "A. spiculosospora" Koguchi et al. 1986
- "A. spinosa" Saitoh et al. 1993
- "A. vulgaris" Hegde et al. 1991
See also
References
- ^ a b c A.C. Parte; et al. "Actinomadura". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2025-02-28.
- ^ a b C.L. Schoch; et al. "Actinomadura". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2025-02-28.
- ^ a b Zhang Z; Kudo T; Nakajima Y; Wang Y (2001). "Clarification of the relationship between the members of the family Thermomonosporaceae on the basis of 16S rDNA, 16S-23S rRNA internal transcribed spacer and 23S rDNA sequences and chemotaxonomic analyses". Int J Syst Evol Microbiol. 51 (Pt 2): 373–383. doi:10.1099/00207713-51-2-373. PMID 11321082.
- ^ Kroppenstedt, RM; Stackebrandt, E; Goodfellow, M (1990). "Taxonomic revision of the actinomycete genera Actinomadura and Microtetraspora". Syst Appl Microbiol. 13 (2): 148–160. doi:10.1016/S0723-2020(11)80162-1.
- ^ "The LTP". Retrieved 10 December 2024.
- ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 10 December 2024.
- ^ "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF). Retrieved 10 December 2024.
- ^ "GTDB release 09-RS220". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2024.
- ^ "bac120_r220.sp_labels". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2024.
- ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2024.